Kungliga Slottsboden är inte en modern företeelse. Runt Kungl. Slottet har det funnits bodlängor sedan 1500-talet, främst på Helgeandsholmens tidigare broar mellan slottet och Gustav Adolfs torg. När dessa revs för att ge plats för Norrbro flyttade handelsbodarna till den nya brons västra del. Bron var ovanligt bred för sin tid och var stenlagd med vida trottoarer som snabbt blev populära promenadstråk och mötesplatser. I samband med att Riksdagshuset byggdes 1904 revs handelsbodarna. Norrbros centrala läge invid slottet har gjort att den än idag är en av Stockholms paradgator.
1983 öppnade butiken på Kungl. Slottet. Den är fortfarande belägen på samma plats på slottets yttre borggård i Kommendantflygeln, som är den vänstra av de två svängda flyglarna, från slottet sett. Anledningen till att byggnaderna är svängda är för att man ville behålla symmetrin utan att riva storkyrkan. Det moderna namnet Kommendantflygeln kommer från Kommendant, den högste befälhavaren i en garnison. Denne hade under kung Karl XV:s tid sin bostad i Kungliga Slottsbodens nuvarande butikslokaler.
När slottet stod färdigt 1754, benämndes flygeln först som slotts cancellie flygel för att den i huvudsak inrymde slottskansliet. Kung Adolf Fredrik var den förste regenten att bruka nuvarande slottet. Under hans tid fanns i bottenvåningen även spruthus, dåtidens benämning på brandstationer, samt ett magasin för brandredskap. Rädslan efter den förödande branden 1697 var fortfarande påtaglig.
I Kommendantsflygeln fanns även rum för sekreterare. Samma lokaler brukades under kung Gustav III:s tid av kanslivaktmästaren och för krogrörelse.
Flygeln fick så småningom växlande uppgifter, såsom lokaler för Högsta domstolen, Borgrätten, Generaladjutanten, Kungl. Livbeväringens orderrum, Myntkabinettet, Kungl. Slottsbyggnadskontoret, Krigshovrätten, arkiv och magasin för slottsknektarna samt bostäder.
Nya behov och stilideal har gjort sig gällande allteftersom nya generationer tagit byggnaderna i besittning. Idag finns såväl kontor samt verksamhet för den Publika avdelningen som ansvarar för att visa de tio kungliga slotten för besökarna.
Det över 40 år sedan en del av den nuvarande inredningen för Kungliga Slottsboden skapades.
Butikens fasta inredning målades i en grå färg som har sitt ursprung i många av de kungliga slottens snickerier och dekorer. Färgen, som kallas för Hårlemangrå, har blivit en naturlig signaturfärg för Kungliga Slottsboden och återfinns även i en liten kollektion produkter.
Idag har såväl utländska turister som svenskar och stockholmare Kungliga Slottsboden som en naturlig inspirationspunkt i staden och gör de inbjudande miljöerna omkring slottet levande. Kanske är det som tydligast under den dagliga vaktavlösningen, då soldaterna paraderar runt den svängda flygeln till många människors glädje och beundran.